Équipe BORIES

Physiopathologie du Myélome Multiple et Immunothérapies de Nouvelle Génération

Au cours de la dernière décennie, les ARN longs non codants (lncARN) sont apparus comme d’importants modulateurs de l’état épigénétique et de la structure de la chromatine. Les lncARN jouent des rôles régulateurs essentiels au cours des processus normaux de développement et de différenciation, et la dérégulation de leur expression est impliquée dans l’apparition et l’étiologie de nombreuses maladies malignes, dont le myélome multiple (MM).

Nous développons des criblages fonctionnels à haut débit ainsi que des approches transcriptomiques et épigénétiques afin d’étudier la contribution des lncARN à différents aspects de la physiopathologie du MM, avec pour objectif d’identifier de nouveaux marqueurs pronostiques et de nouvelles cibles thérapeutiques. Nos travaux récents se sont concentrés sur un lncARN, appelé CRNDE, dont l’expression est augmentée dans les plasmocytes tumoraux des patients atteints de MM et qui contribue à la prolifération et à la survie des cellules de MM.

Afin de comprendre son mécanisme d’action, nous avons récemment réalisé un criblage moléculaire à haut débit pour identifier les protéines partenaires interagissant avec CRNDE. Cette étude a révélé que, dans les cellules de MM, CRNDE interagit avec la protéine désacétylase SIRT1 et la stabilise, ce qui entraîne des effets en aval sur la signalisation Hedgehog, une voie importante pour la survie et les propriétés d’autorenouvellement des cellules tumorales de MM.

Dans nos travaux en cours, nous combinons le profilage transcriptomique d’échantillons de patients avec des criblages fonctionnels à haut débit basés sur CRISPR de lncARN exprimés de manière différentielle, afin d’identifier de nouveaux lncARN influençant les propriétés tumorigènes des cellules de MM ainsi que le développement de résistances aux immunothérapies.

Les lymphocytes T exprimant un récepteur antigénique chimérique (CAR T) ciblant l’antigène BCMA (B Cell Maturation Antigen) actuellement utilisés pour traiter les malades atteints de MM offrent des taux de réponse impressionnants, mais de nombreux patients rechutent et développent des résistances. Nos recherches, adossées à des essais cliniques, visent à identifier les mécanismes moléculaires associés à la résistance des plasmocytes tumoraux à la thérapie CAR T et à développer des stratégies CAR améliorées, d’abord pour le MM puis pour d’autres hémopathies lymphoïdes.

Identification des mécanismes de résistance des plasmocytes tumoraux à l’activité des CAR T anti-BCMA.

L’analyse des données cliniques des malades traités par CAR T anti-BCMA (Ide cel) montre de bons taux de réponse, mais une survie sans progression relativement courte (< 13 mois). En combinant des stratégies génomiques (RNAseq) sur les plasmocytes des malades, ainsi que des méthodes de criblage fonctionnelles (CRISPR/Cas9) in vitro, nous cherchons à identifier les gènes associés à la résistance des cellules de MM aux CAR T. Nos résultats permettront de mieux prédire la survie des malades et d’améliorer l’activité des cellules thérapeutiques in vivo.

Caractérisation des mécanismes régulant la persistance in vivo des cellules CAR T.

Nos résultats indiquent que les CAR T issus de patients lourdement prétraités présentent une efficacité réduite in vivo [D1] et chez la souris, comparativement aux CAR-T dérivés de patients au diagnostic ou de donneurs sains. Ces données, et celles de la littérature, suggèrent que les rémissions cliniques de courte durée observées chez les patients MM après une thérapie par CAR-T sont le plus souvent attribuées à des processus d’épuisement, conduisant à une persistance limitée et à un dysfonctionnement des lymphocytes T thérapeutiques. Nous développerons des stratégies de criblage fonctionnel à l’échelle du génome (CRISPR/cas9) afin de caractériser les gènes dont l’inactivation améliore la persistance des CAR T anti-BCMA dans un modèle murin de MM. Ce programme apportera de nouvelles connaissances sur les mécanismes associés à la persistance des CAR T dans le MM et pourraient fournir des données applicables à d’autres cancers.

Développement de nouveaux CAR T.

Malgré les résultats cliniques impressionnants obtenus avec des CAR T ciblant BCMA, de nombreux patients rechutent et le MM demeure une maladie incurable. La majorité des essais cliniques ont évalué des CAR contenant des domaines de signalisation issus des molécules CD3z et 4-1BB (ou CD28), sans que l’on sache si ces associations sont optimales. Des travaux récents menés par des membres de l’équipe ont proposé de nouvelles approches : (i) nouvelles cibles sur les cellules de MM (CCR10/ ITGB7); (ii) différents domaines de signalisation; (iii) CAR T doubles ciblant les antigènes CD38 et CS1. Nous combinons et testons ces modifications afin d’améliorer l’efficacité des CAR T doubles dans le MM et dans d’autres hémopathies malignes.